因构象搜索、几何优化、磁屏蔽张量计算、数据分析的时间复杂程度各不相同，故建议使用如下顺序逐渐递进进行计算，以达到满意的结果。

建议同一批候选结构在生成 3D 结构时基于 ChemDraw 绘制的同一个结构，避免在此繁琐地逐个对照编号。

GFN2NMR 最先进行，因其快速而方便，且构象搜索结果可用于评估后续其他方法计算时间。可在任意文件夹直接调用shell脚本运行；

MM-DP4+，ML-J-DP4 和 dJ-DP4 由于构象搜索/几何优化级别一致，运行时将提示用户是否已完成 MMFF94 级别下的优化，如已完成，直接选择存有相应文件的 MMFF94 文件夹即可直接跳过构象搜索/几何优化计算。

ML-J-DP4 极快，可用于结合关键位点耦合常数数据的判断，但数据处理需于自己的电脑（Windows）下载其app，较为繁琐，嫌麻烦可暂缓；

**MM-DP4+**快，数据处理需下载DP4plus-App；

dJ-DP4 快，可用于结合关键位点耦合常数数据的判断；

DP4+ 中等，可靠但耗时。数据处理需下载DP4plus-App；

ANN-PRA 用于解决“一对一”判断结构正误问题，不必为多个候选结构间的判断（而其他方法均建议用于解决后者）

ANN-PRA 2013 快

ANN-PRA 2015 中，数据处理时需按标准格式指明CH连接关系，等效氢需自行平均化处理。

DP4+ 和 ANN-PRA 2015 由于构象搜索/几何优化级别一致，运行时将提示用户是否已完成B3LYP/6-31G(d)级别下的优化，如已完成，直接选择存有相应文件的B3文件夹即可直接跳过构象搜索/几何优化计算。

STS 慢，几乎是目前计算碳谱准确度最高的方法，因此不仅可以用于非对映体比较，还可直接通过实验值和预测值的偏差指导结构正确与否的判断。但慢；

MESSI 慢，仅建议用于含大量分子间氢键的大极性分子非对映体间判断。