计算级别
几何优化:MMFF94
核磁计算:B3LYP/6-31G(d,p)
数据处理:Excel
特点:可以同时比较化学位移和耦合常数的实验值与预测值的差异进而给出判断。
计算目标:非对映体比较。
适用溶剂:/
计算位置:/home/zhb/calculation/code/dJ_DP4
计算方法
输入文件:推测结构的 .xyz 文件(可由 x2xyz.sh 得到)
参数文件:修改 Jinput.txt 内容,标明需要提取耦合常数的原子对,按照如下格式声明:
a b c d ... x y
其中字母指代原子编号,前一编号应小于后一编号.
运行:于计算位置打开终端,运行 ./dJ_DP4
结果:得到的每个候选结构的各个构象的权重以及经构象平均后的磁屏蔽张量和 指定的耦合常数输出在 nmr 文件夹中的 *_result.txt 中。
数据处理方法
处理工具:计算位置下 tool 文件夹中 j-dp4_calculator.xlsx 文件。
注:实验值上等价的氢需要手动将相应位置计算得到的磁屏蔽张量进行平均化处理。